La respiración puede definirse como el proceso de absorber un gas dentro de un organismo para aprovechar sus características químicas y moleculares como un motor de combustión interno ya sea dependiendo directamente del oxigeno o de otra sustancia gaseosa o inclusos de no usar ninguna
Las becarias pueden ser identificadas por la capacidad respiratoria que tienen, ya que no todas dependen del oxigeno para sobrevivir
Respiración aerobia: Es el tipo de respiración mas eficiente en cuanto a términos de producción de energía, todos los seres de celularidad eucarionte la poseen como respiración predeterminada ademas de algunos grupos de bacterias, este tipo de respiración es mas eficiente ya que las moléculas de oxigeno atraviesan las membranas celulares con facilidad y llegan a las mitocondrias donde se almacenan para luego ser utilizar sus electrones y protones como un filtro para la fosforilacion y formación del ATP
Es en las mitocondrias donde se lleva acabo el ciclo de Krebs, la ruta metabólica donde se generan y se utiliza el O2

Respiración anaerobia (Fermentación): Se trata del segundo sistema respiratorio que poseen algunas de las bacterias y que puede ser usado en caso de emergencia o deficiencia de energía por los organismos eucariontes, este tipo de respiración no depende de la parecencia de oxigeno para efectuarse y puede generarse sin el, sin embargo, se trata del sistema respiratorio y de producción de mas ineficiente que existe, ya que este tipo de respiración usa a la glucosa pero se salta el proceso de glucolisis (y algunos otros), mientras la respiración aerobia produce 38 moléculas de ATP por cada molécula de glucosa, la respiración anaerobias solo produce 2 moléculas de ATP por cada molécula de glucosa
Sin embargo este tipo de respiración es mas rápido y le permite sobrevivir a las bacterias en zonas que para nosotros serian toxicas o inhabitables
Respiración anaerobia facultativa: Se trata de un tipo de respiración que algunas bacterias poseen y les permite sobrevivir en ambientes con y sin oxigeno, pudiendo alternar su respiración de aerobia a anaerobia según sea la necesidad, estos grupos de bacterias suelen ser la primera causa de errores de identificación en laboratoristas clínicos inexpertos, por sus capacidades para alterar su respiración